会社のルールで計算して上限3万円迄が支給されるという事だと思います。
多少不便でも安い経路があればそちらで計算してという場合が多いと思います。
詳細は会社毎に違いますので要確認ですが、値段の違う複数の経路がある場合などは
使う経路と違う道順で計算される事もあるかと。
3万円を越える分に付いては自己負担と、3万円以下でも会社のルールとは違う場合には負担がどうなるかは全くわかりません。
例えば車通勤不可な職場で車で通勤するような場合には交通費がどんな形で出してもらえるか・出してもらえないか全く不明です。
必要なら事前に確認した方が良いと思います。